南京農業(yè)大學成人高等教育起步較早，從1957年起就開辦了函授農學專業(yè)本科班和特別班。1983年經原國家教委、農牧漁業(yè)部批準，成立了中央農業(yè)管理干部學院南京農學院分院，后更名為中央農業(yè)干部教育培訓中心南京農業(yè)大學分院。1992年成立成人教育學院，2010年3月更名為繼續(xù)教育學院。

目前，繼續(xù)教育學院和中央農業(yè)干部教育培訓中心南京農業(yè)大學分院兩塊牌子，一套班子。下設辦公室、培訓科、教務科、招生自考辦公室及遠程教育科五個科級管理機構，專門負責學校成人學歷教育和非學歷教育（各類培訓）的辦學和管理。

學歷繼續(xù)教育：成人教育:辦學形式有函授、業(yè)余，辦學層次有高起本、專升本、高起專，本、?？茖I(yè)共30多個，涉及農、工、理、管理、經濟等門類。現(xiàn)有各類成人學歷教育在讀學生16000余人，在籍學生數(shù)居全國農業(yè)院校和江蘇省高等院校前列。學院本著合理布局、優(yōu)勢互補的原則，在全國建立了一批函授站和教學點，有效地實施了校校、校企、校地聯(lián)合辦學，取得了良好的社會效益和經濟效益。自學考試：我校是江蘇省自學考試《農藝》、《企業(yè)管理》、《農業(yè)經濟管理》、《金融》、《國際貿易》、《現(xiàn)代農業(yè)管理》六個專業(yè)的主考學校，目前還開辦了《日語》、《現(xiàn)代農業(yè)管理》、《現(xiàn)代園藝》、《財務管理》四個“專接本”專業(yè)及《金融》、《財務管理》、《園林》三個“助學二學歷”專業(yè)。學院積極參與江蘇省面向農村自學考試實驗區(qū)工作，承擔了三大類六個專業(yè)方向的主考任務。

非學歷繼續(xù)教育(各類培訓)：學院主要面向農業(yè)系統(tǒng)領導干部、農業(yè)技術推廣人員、新型職業(yè)農民、農村實用人才、中等農業(yè)職業(yè)學校骨干教師等開設了40余項培訓項目。先后被農業(yè)部確定為“農業(yè)部現(xiàn)代農業(yè)技術培訓基地” 、“農業(yè)職業(yè)技術教育培訓示范基地”；被江蘇省委組織部認定為“江蘇省干部教育培訓高?；亍保唤K省教育廳確定為“江蘇省中等職業(yè)教育師資培養(yǎng)培訓基地”；被南京市委組織部選定為“南京市處級干部進高校培訓”首批高校、被新疆克州黨委組織部認定為“克州干部赴內地培訓基地”，學院將充分發(fā)揮學校的優(yōu)質教育教學資源，結合學校科技成果的推廣和轉化，與部省共同建設好培訓基地，為“三農”培訓更多的優(yōu)秀人才。

近年來，學院為全面適應二十一世紀社會經濟對人才培養(yǎng)的需求，努力轉變辦學思想，更新教育觀念，以質量求發(fā)展，不斷開拓辦學思路，形成了以成人學歷教育和崗位、技能培訓等非學歷教育并重的全方位、多渠道、多層次、多形式的辦學體系。

新時期，社會賦予了成人高等教育新的使命和任務。學校成人高等教育將深入貫徹落實科學發(fā)展觀，堅持正確的辦學方向，進一步強化學歷教育與非學歷教育并舉發(fā)展的思路，在不斷提高教育質量的道路上，不斷開拓進取，再造新優(yōu)勢，再創(chuàng)新輝煌，力爭為我國經濟建設和社會發(fā)展培養(yǎng)更多高質量的專門人才。